B医院（公益性医院）向A 公司购买药品，购、销双方签订协议，约定购货经营额在100万元以下的，按1％返利，达到100万元以上的按2％的折扣由A 公司返利给B 医院，每年年终结算一次。本年度B 医院陆续向A 公司购买了大量的药品，并陆续支付了所有货款，A 公司在收取货款后，将经营费用科目中的相关款项支付B 医院85万元的让利款。B 医院将这笔款项入账在“药品进销差价”科目内，年终转“利润”科目再转“事业基金科目”。“事业基金”科目是可以由医院自主支配，用于基本建设的科目。（注：不论B 医院经营是否亏损，该款项都转入“事业基金”科目）

该笔款项证实是利润的话，可否由医院自由支配？